As Escolas de Evangelização Santo André no Brasil possuem um Conselho Nacional que é o órgão de autoridade responsável pela coordenação geral.

Compete ao Conselho Nacional:

• Promover o Projeto Santo André conservando sua identidade e carisma;
• Multiplicar EESAs com sua própria Visão, Programa e Metodologia;
• Certificar as Escolas do país, segundo as orientações do Escritório Internacional;
• Emitir documentos internos e aplicar a Bússola (guia básico das EESA);
• Buscar uma maior integração das Escolas e formadores.